Mit den folgenden Programmen lassen sich schnell und einfach Wissen bzw. Vorhaben und Projekte organisieren. Die Programme sind entweder schon installiert, oder lassen sich bequem über Synaptic nachinstallieren.

Mindmaps:

• Labyrinth (Paket: labyrinth)
  Sehr komfortabel. Einfach und schnell.
• Freemind (Paket: freemind)
  Der Klassiker. Gigantischer Umfang. Braucht JAVA (z.B. in Packet ubuntu-restricted-extras)

Notizen:

• Tomboy (unter Ubuntu bereits installiert)
  Praktische Notizzettel im Panel, die sich verlinken lassen. Durchstreichen und highlighten von Einträgen. Lässt sich über einen FTP oder WebDAV synchronisieren.
• NoteCase (Paket: notecase)
  Läuft nicht nur auf dem Desktop sondern auch auf dem N810 unter Maemo.

R (R-Project) kann bekanntlich mit sämtlichen lokalen Daten gefüttert werden. Um Daten aus einer MySQL-Datenbank auszulesen, brauchen wir das R-Paket RMySQL, welches sich des Backends DBI (DataBase Interface) bedient. Damit die Installation des Pakets unter Ubuntu Linux glatt durchläuft, installieren wir vorab (außerhalb von R!) das Paket libmysqlclient-dev via

sudo apt-get install libmysqlclient-dev

(evlt. benötigt man noch das META-Paket build-essential, was aber bei der Installation des Paket in R auffallen wird. Wobei man die build-essential(s) immer (more…)

Hier mal ein etwas anderer Werbespot zu Linux.

“Collecting data is only the fist step toward wisdom. But sharing data is the first step toward community.”

“Wissen zu sammeln ist nur der Schritt zur Weisheit, aber Wissen zu teilen ist der ersten Schritt zu einer Gemeinschaft.”

“What he learns, we all learn”

“Was er lernt, lernen wir alle.” (more…)

Ohne mich jetzt groß über R (r-project.org) auszulassen will ich auf ein paar nützliche Einstiegshilfen verweisen. Die vom R-Project selbst herausgegebenen offiziellen Handbücher liegen als HTML und PDF Dateien vor und werden regelmäßig aktualisiert und erweitert. Zwei wirklich sehr gute Scripte hat Andreas Plank online gestellt:

• “Grafiken und Statistik in R” gibt Hilfe für einen Blitzstart und Kochrezepte (copy&paste Code), die schnell über anfängliche Hürden hinweg helfen. Darüber hinaus sind die wissenschaftlichen Bedeutungen der Funktionen und derer Rückmeldungen / Ausgaben erklärt.
• “Grafiken in R” ist ein Katalog, der die extrem vielen Möglichkeiten zur grafischen Datenpräsentation aufzeigt. Dabei ist zu jeder beispielhaften Grafik das notwendige Paket und die genutzte Funktion angegeben. Mehr Beispiele gibt es in der R Graph Gallery.

Weitere Quellen im Netz sind:

• R Befehlsreferenz Kärtchen
• Einführung in R - Statistical Computing
• Datenanalyse mit R (Hydro, Forst, Geo)
• Einführung in das Arbeiten mit R
• simpleR
• usingR (→ usingR.pdf)
• A Brief Guide to R for Beginners in Econometrics
• R for Beginners
• Practical Regression and ANOVA using R (Autor)
• R-Kurs von Gene Hunt (Paleobiologe) in 5 Teilen: 1, 2, 3, 4, 5. Sein R-package paleoTS hat er in einem Artikel erklärt.

Viele, viele weitere PDFs liegen unter /doc/contrib/ auf dem R-Project Server. Lohnt sich auch mal ein Verzeichnis nach oben zu wechseln und da zu graben.

Bücher
“An Introduction to R” gibt es auch als Buch zu kaufen. Ein weiteres sehr gutes Buch, dass sich mit R und weniger mit den statistischen Methoden beschäftigt, ist “Programmieren mit R” von Uwe Ligges, der auch selbst R-Pakete entwickelt. “The R Book” beschäftigt sich auch mit den Methoden, die in R umgesetzt werden können. Das Buch “Time Series Analysis and Its Applications: With R Examples” ist für die fortgeschrittenen Zeitreihenanalyse geeignet; Beispieldatensätze und R Code haben die Autoren hier veröffentlicht. Für die Geostatistik empfiehlt sich “Model-based Geostatistics” - Das Handbuch zum R-Paket geoR. Weitere Bücher zu R sind unter R-Books gelistet. (Kleiner Tipp am Rande: Bei bol.de gibt’s englische Bücher zur Zeit mind. 10% billiger als in anderen Shops.)

Hilfe für Fortgeschrittene / R-Suchplugin
Du hackst in R, bist aber auf ein für Dich unlösbares Problem gestoßen? Hilfe gibt’s in der R-Mailingliste. Bevor man aber eine Anfrage an die Empfänger der Liste stellt, sollte man sich vergewissern, dass dieses Problem nicht schon vorher diskutiert worden ist. Zum komfortablen Durchsuchen der bisherigen Themen der Mailingliste, habe ich ein Suchplugin / search plugin für Firefox erstellt, das sich durch einen Klick auf das unten stehende R-Logo installieren lässt:

Grafische Benutzeroberflächen (GUIs)
Für R gibt es einige dedizierte GUIs, aber auch einige Editoren (Kate, Emacs, Bluefish,…) haben “Verständnis” für R. Eine Auflistung findet man hier. Am ansprechendsten finde ich diese hier:

• RKWard
• Java GUI for R
• The R Commander
• Statistiklabor
• Bluefish

R mit Sweave
Links und Screencast hier: R and Sweave in Textmate

Installation unter openSuSE
Neben Windows läuft R selbstverständlich auch auf MacOS und Linux. Nutzer von openSuSE können sich bequemer Weise das YaST Repository von Detlef Steuer einbinden, und dann in der Software-Verwaltung nach R-base suchen.

R, R-Project

Endlich ist bewiesen, was ich schon lange vermutet habe: Die Beurteilung von Musikstücken hängt stark von der Meinung anderer ab (wissenschaft.de, 10.01.06). Gut, dass es dennoch Menschen mit eigenem Geschmack gibt. Stellt man einigen Leuten neue Musiktitel vor werden diese oft als schlecht bewertet. Kommen diese Titel nach Monaten in die Charts und laufen im Radio “rauf und runter”, kaufen sich die selben Leute die Maxi-CD.

Aufgrund des dramatischen Rückgangs der natürlichen Feinde der Ratten, vermehren sich diese enorm. Im Bereich der Kanalisation können sie gezielt bekämpft werden, aber nicht in der freien Natur. Ratten können Leptospirose übertragen. Auch, wenn sie in Gewässer urinieren. Unerschrockene Naturburschen, die auf die Reinheit der Natur vertrauen, können sich so schnell mit grippeähnlichen Symptomen im Krankenhaus wieder finden.
Kurios: Die Rattenpopulation im Pariser Abwassersystem beseitigt / verstoffwechselt täglich 800 Tonnen Müll.

Ascorbinsäure hilft nicht vorbeugend und während Erkältungen. Es sei denn, man ist extremen körperlichen Belastungen ausgesetzt, wie z.B. Leistungssportler oder Soldaten. Für den normalen Menschen hat die Einnahme von Vitamin C keine Auswirkung auf den Krankheitsverlauf. Ich hab das ja schon immer gepredigt. Mein Biolehrer wußte das schon. Man muß sich also nicht beim ersten Kratzen im Hals kiloweise Obst reinstopfen. Es gibt Spezialisten, die sich gar mit der 20fachen Tagesdosis an Vitamin C mit Retardkapseln vollpumpen. Ganz nach dem Motto: Kinderschokolade ist ja auch ganz gesund und hat viel Milch drin. Die Werbung macht’s.

• Das Ende der Vitamin-C-Legende, wissenschaft.de
• Regular vitamin C does not prevent colds, NewScientist

Worldwind

Die NASA hat mit dem Softwarepaket Worldwind Satelliten-, Luftbilder und topographische Karten unter einen Hut gebracht. Die LandSAT-Aufnahmen werden durch SRTM-Daten zu Höhenmodellen ergänzt, so daß eine 3D-Landschaft entsteht. So ist ein virtueller Blick vom Bodensee auf die Alpen möglich. Für die USA ist dank USGS die Abdeckung mit topographischen Karten und Luftbildern gegeben. Ein absolutes Highlight sind die urban orthos (städtischen Luftbilder), deren Abdeckung sich auf die Ballungszentren beschränkt. Damit ist ein Blick von der Golden Gate Brücke möglich. Das 180MB (more…)

Das Gefühl etwas schon einmal gesehen oder erlebt zu haben tritt besonders häufig bei jungen Menschen zwischen 15 und 25 Jahren auf. Die Erklärung dafür könnte eine kurzzeitige Störung in der Matrix sein. Man geht heute jedoch von einer Extratour des Parahippocampus aus, der ohne Beteiligung des Hippocampus ein Vertrautheitsgefühl auslöst (Ärztezeitung, 04.02.2005). Der Hippocampus ist für das bewußte Erinnern von Erlebnissen verantwortlich. Der Parahippocampus bewertet nur den Reiz an sich als vertraut oder unvertraut - ohne dafür die dazugehörige Erinnerung abzurufen. Bewertet der Parahippocampus eine Situation als vertraut ohne, daß der Hippocampus dazu eine Erinnerung liefert, kommt es zum Deja vu. Wir glauben die Situation zu kennen, können diese aber nicht einordnen.

Für die Entstehungsgeschichte des Mondes haben sich vier Theorien herauskristallisiert: Abspaltungs-, Schwester-, Einfang- und Einschlagstheorie. Die derzeit für richtig gehaltene ist die Einschlagstheorie, nach der ein Planetoid von der Größe des Marses mit der Erde zusammen stieß. Wissenschaftler am SwRI haben die Ergebnisse ihrer Simulation der Kollision in einem VideoClip (QT, 3.5MB) dargestellt. Zeitspanne im VideoClip: 24 Stunden. Am Ende der Darstellung hat ein Erdentag fünf Stunden.